L’influence des aliments sur les organismes qui les ingèrent est considérable : constitution physique (poids, peau, ongles, cheveux, les yeux,...), effets sur la psychologie et les comportements humains, etc. Par exemple une alimentation déséquilibrée peut contribuer à des manques de nutriments dans l'organisme :
des manques en FER sont à l'origine de fatigues, d'essoufflements, de crampes musculaires, de pâleurs, de mains et pieds froids, de maux de tête, d'altération de la concentration et des capacités d’apprentissages,...
des manques en vitamine B3 sont à l'origine de troubles psychologiques, ...
des manques en iode favorisent fatigue, prise de poids, ...
Ainsi des manques, mais aussi des excès (→ Les excès alimentaires) de nutriments dans l'organisme peuvent nuire à celui-ci, d'où l'importance d'une alimentation équilibrée.
Les aliments contiennent parfois des particules (polluants, etc) ou micro-organismes (parasites, etc) nuisibles à l'organisme qui les ingère.
La naturopathie par ses conseils favorise l'équilibre alimentaire et des aliments sains de qualité.